Cụ thể, công ty TNHH Quốc tế Chutex (Chutex) chuyên sản xuất hàng may mặc xuất khẩu cho những thương hiệu nổi tiếng cho biết, Chutex nhập khẩu hàng hóa theo loại hình gia công, sau đó giao toàn bộ nguyên liệu cho công ty nằm trong khu chế xuất, phi thuế quan để gia công lại và nhận sản phẩm thành phẩm để xuất khẩu. 

Cuối tháng 8/2011, Cục Hải quan Bình Dương ban hành quyết định ấn định thuế, truy thu đối với Chutex số tiền lên gần 36 tỷ đồng. Đến nay, công ty lại tiếp tục bị Cục Hải quan ấn định, truy thu thuế. 

Tương tự với Công ty TNHH Pung Kook Sài Gòn II (Pung Kook II). Tháng 8/2019, công ty này bất ngờ nhận được quyết định truy thu thuế và xử phạt với tổng số tiền hơn 31 tỷ đồng của Cục Hải quan Bình Dương. 

Hai doanh nghiệp cho rằng việc truy thu thuế này là hoàn toàn không đúng với quy định về luật thuế nên đã gửi đơn “cầu cứu” lên Chính phủ, Bộ Tài chính và Tổng cục Hải quan. 

Mới đây, Tổng cục Hải quan đã có chỉ đạo các Cục Hải quan tỉnh, thành phố thực hiện kiểm tra hồ sơ hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, sổ sách, chứng từ kế toán, chứng từ thanh toán và các tài liệu có liên quan… 

Theo đó, cơ quan hải quan cho rằng, trường hợp doanh nghiệp trong khu phi thuế quan gia công lại không sử dụng nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nước ngoài (doanh nghiệp nội địa cung cấp toàn bộ nguyên liệu, linh kiện cho doanh nghiệp trong khu phi thuế quan) thì sản phẩm gia công khi nhập khẩu vào thị trường trong nước được miễn thuế nhập khẩu. 

Trường hợp doanh nghiệp trong khu phi thuế quan gia công lại có sử dụng nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nước ngoài thì sản phẩm gia công khi nhập khẩu vào thị trường trong nước phải kê khai, nộp thuế theo quy định của Tổng cục Hải quan. 

Như vậy, đối với trường hợp công ty Chutex và công ty PungKook II ký kết hợp đồng gia công với thương nhân nước ngoài nhưng thuê doanh nghiệp trong khu phi thuế quan gia công sản phẩm (thuê gia công lại), Tổng cục Hải quan khẳng định: “Hai công ty này cung cấp toàn bộ nguyên liệu, linh kiện cho doanh nghiệp trong khu phi thuế quan để gia công, sau đó nhận lại sản phẩm để xuất khẩu ra nước ngoài thì được miễn thuế nhập khẩu”.

Chính vì vậy, Tổng cục Hải quan đề nghị các doanh nghiệp liên hệ với cơ quan hải quan nơi làm thủ tục nhập khẩu để được xử lý miễn thuế theo hướng dẫn nêu trên. 

Trước đó, cuối tháng 8/2011, Cục Hải quan Bình Dương từng ban hành quyết định ấn định thuế, truy thu đối với Chutex số tiền lên gần 36 tỷ đồng. 

Trong khi đó, theo báo cáo của Pung Pook II, từ tháng 11/2014 - 9/2016, doanh nghiệp đã được hoàn thuế hơn 3,6 tỷ đồng và một số khoản khu khác từ ngân sách nhà nước. Đang được hoàn thuế, thậm chí có giai đoạn được miễn thuế (năm 2018), thì tháng 8/2019, doanh nghiệp này bất ngờ nhận được liên tiếp 2 quyết định của Cục Hải quan Bình Dương về việc truy thu thuế và xử phạt với tổng số tiền hơn 31 tỷ đồng. 

Thanh Hoa