Cụ thể, doanh nghiệp khai sai nhưng không dẫn đến thiếu số thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) phải nộp, đồng thời khai sai dẫn đến thiếu số thuế giá trị gia tăng (GTGT). Các hành vi này vi phạm khoản 1 Điều 141 và khoản 1 Điều 142 Luật Quản lý thuế năm 2019, cũng như khoản 3 Điều 12 và khoản 1 Điều 16 Nghị định số 125/2020/NĐ-CP về xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực thuế và hóa đơn. Trong trường hợp này, cơ quan thuế xác định không có tình tiết tăng nặng hay giảm nhẹ.

Doanh nghiệp bị áp dụng hình thức xử phạt chính bằng tiền với tổng mức 31.492.279 đồng, trong đó 18.492.279 đồng phạt hành vi khai sai dẫn đến thiếu số thuế GTGT và 13.000.000 đồng phạt hành vi khai sai nhưng không dẫn đến thiếu số thuế TNDN. Cơ quan thuế còn truy thu số thuế GTGT thiếu phải nộp là 92.461.395 đồng và tính tiền chậm nộp thuế là 22.239.943 đồng. Số tiền chậm nộp này được tính đến hết ngày 21/11/2025.

Tổng cộng, số tiền truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp mà Tổng Công ty Phong Phú phải nộp vào ngân sách nhà nước là 146.193.617 đồng. Quyết định cũng nêu rõ doanh nghiệp phải giảm số lỗ năm 2019 với giá trị 7.681.844.859 đồng và không được chuyển số lỗ này sang các năm tiếp theo. Việc này có thể ảnh hưởng trực tiếp đến kết quả kinh doanh và nghĩa vụ thuế TNDN của các năm tiếp theo, đặc biệt đối với doanh nghiệp có quy mô lớn như Phong Phú.

Về tình hinh kinh doanh, Tổng Công ty Cổ phần Phong Phú đạt gần 628 tỷ đồng doanh thu, xấp xỉ mức của quý 3 năm trước. Việc giá vốn giảm khoảng 3% giúp biên lợi nhuận gộp cải thiện từ 17,2% lên 19,3%. Đáng chú ý, khoản lợi nhuận đem về từ các công ty liên kết tăng 24%, vượt 97 tỷ đồng, qua đó góp phần đưa lợi nhuận ròng vượt 93 tỷ đồng, tương đương mức tăng 30%. 

Doanh nghiệp cho biết hoạt động quý 3 thuận lợi nhờ nhu cầu thị trường duy trì ổn định, lượng đơn hàng cải thiện và đóng góp tích cực từ các đơn vị liên doanh, liên kết.

Lũy kế 9 tháng đầu năm, Phong Phú ghi nhận hơn 1.832 tỷ đồng doanh thu và 306 tỷ đồng lợi nhuận sau thuế, tăng lần lượt 10% và 23% so với cùng kỳ. Các kết quả này tương ứng 70% kế hoạch doanh thu và 89% mục tiêu lợi nhuận cả năm.

Tại ngày 30/9/2025, tổng tài sản của doanh nghiệp đạt 3.754,4 tỷ đồng, tăng 4,9% so với đầu năm. Tài sản ngắn hạn đạt gần 1.884 tỷ đồng, trong đó tiền và tương đương tiền đạt 133,3 tỷ đồng. Hàng tồn kho giảm xuống còn 503,4 tỷ đồng, giảm hơn 100 tỷ đồng so với hồi đầu năm.

Về nguồn vốn, nợ phải trả gần như đi ngang với mức 1.716,4 tỷ đồng. Trong khi đó vốn chủ sở hữu tăng 12,4% lên mức 2.038,2 tỷ đồng.

Xuân Bắc